Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Rnf4Q9QZS2 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf4Q9QZS2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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