Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc4Q9QZD4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms