Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Kcnip3Q9QXT8 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Kcnip3Q9QXT8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Kcnip3Q9QXT8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Kcnip3Q9QXT8 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Kcnip3Q9QXT8 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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