Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ChmQ9QXG2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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