Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Crlf1Q9JM58 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Crlf1Q9JM58 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms