Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nectin3Q9JLB9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms