Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Mrpl39Q9JKF7 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms