Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl28Q9JIL2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl28Q9JIL2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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