Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
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Rb1cc1Q9ESK9 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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Rb1cc1Q9ESK9 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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Rb1cc1Q9ESK9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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Rb1cc1Q9ESK9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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Rb1cc1Q9ESK9 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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