Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms