Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Usp29Q9ES63 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Usp29Q9ES63 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Usp29Q9ES63 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Usp29Q9ES63 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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