Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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