Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Myl1-202ENSMUST00000119429 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 E130120K24Rik-201ENSMUST00000129910 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Vmn1r113-202ENSMUST00000173723 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm34263-201ENSMUST00000214010 352 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 AC154635.1-201ENSMUST00000221433 400 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Spink10-201ENSMUST00000055725 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Gm14339-201ENSMUST00000146224 423 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Gzma-202ENSMUST00000224282 996 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Tmco5-201ENSMUST00000028834 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms