Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms