Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Smg9Q9DB90 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Smg9Q9DB90 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Smg9Q9DB90 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Smg9Q9DB90 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Smg9Q9DB90 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Smg9Q9DB90 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Smg9Q9DB90 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Smg9Q9DB90 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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