Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Chmp4bQ9D8B3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms