Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms