Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Fndc8Q9D2H8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Fndc8Q9D2H8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Fndc8Q9D2H8 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Fndc8Q9D2H8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Fndc8Q9D2H8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Fndc8Q9D2H8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Fndc8Q9D2H8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Fndc8Q9D2H8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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