Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Tmem88Q9D0N8 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Tmem88Q9D0N8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Tmem88Q9D0N8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Tmem88Q9D0N8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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