Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed3Q9D0L1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms