Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Cir1-201ENSMUST00000058615 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ChtopQ9CY57 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ChtopQ9CY57 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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