Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mis12Q9CY25 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms