Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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Pfdn1Q9CWM4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Pfdn1Q9CWM4 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Pfdn1Q9CWM4 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Pfdn1Q9CWM4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Pfdn1Q9CWM4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Pfdn1Q9CWM4 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Pfdn1Q9CWM4 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Pfdn1Q9CWM4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pfdn1Q9CWM4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pfdn1Q9CWM4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pfdn1Q9CWM4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pfdn1Q9CWM4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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