Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rwdd1Q9CQK7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms