Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ergic3Q9CQE7 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ergic3Q9CQE7 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ergic3Q9CQE7 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ergic3Q9CQE7 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ergic3Q9CQE7 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ergic3Q9CQE7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms