Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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