Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Pkp2Q9CQ73 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms