Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp16Q99LG0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms