Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gps1Q99LD4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms