Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ciao1Q99KN2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms