Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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Usp11Q99K46 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Usp11Q99K46 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Usp11Q99K46 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Usp11Q99K46 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Usp11Q99K46 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Usp11Q99K46 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Usp11Q99K46 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp11Q99K46 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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