Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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TirapQ99JY1 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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TirapQ99JY1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TirapQ99JY1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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