Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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