Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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