Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
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Ctu1Q99J10 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
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Ctu1Q99J10 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Ctu1Q99J10 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Ctu1Q99J10 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Ctu1Q99J10 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Ctu1Q99J10 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Ctu1Q99J10 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Ctu1Q99J10 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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