Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn16Q925N4 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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