Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rnf144aQ925F3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Rnf144aQ925F3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
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Rnf144aQ925F3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
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