Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5530-201ENSMUST00000117185 985 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Mterf1a-201ENSMUST00000044746 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnhd1-201ENSMUST00000106776 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm33112-201ENSMUST00000193971 699 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r210-201ENSMUST00000072044 921 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms