Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG5

Ppcs, Phosphopantothenate--cysteine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpcsQ8VDG5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PpcsQ8VDG5 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms