Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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