Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hecw1Q8K4P8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hecw1Q8K4P8 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms