Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OptnQ8K3K8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OptnQ8K3K8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OptnQ8K3K8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OptnQ8K3K8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OptnQ8K3K8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OptnQ8K3K8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OptnQ8K3K8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OptnQ8K3K8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OptnQ8K3K8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
OptnQ8K3K8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
OptnQ8K3K8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OptnQ8K3K8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms