Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Abcf3Q8K268 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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