Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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