Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brf1Q8CFK2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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