Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdc34Q8CFI2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms