Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx8Q8CFD4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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