Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Lrif1Q8CDD9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrif1Q8CDD9 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Lrif1Q8CDD9 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrif1Q8CDD9 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Lrif1Q8CDD9 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrif1Q8CDD9 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Lrif1Q8CDD9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Lrif1Q8CDD9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrif1Q8CDD9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lrif1Q8CDD9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Lrif1Q8CDD9 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Lrif1Q8CDD9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Lrif1Q8CDD9 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Lrif1Q8CDD9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Lrif1Q8CDD9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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