Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ufl1Q8CCJ3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufl1Q8CCJ3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms