Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Nhlrc3Q8CCH2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Nhlrc3Q8CCH2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Nhlrc3Q8CCH2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Nhlrc3Q8CCH2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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